Pertumbuhan madrasah di Indonesia tidak dapat dilepaskan dari akar sejarah pendidikan Islam. Pendidikan Islam di Indonesia merupakan warisan peradaban Islam dan sekaligus aset bagi pembangunan pendidikan Nasional. Sebagai suatu warisan ia merupakan amanat sejarah yang harus terus dipelihara dan dikembangkan oleh umat Islam dari masa ke masa. Sedangkan sebagai aset pendidikan Islam yang terbesar di berbagai wilayah ini, membuka kesempatan bagi bangsa Indonesia untuk menata dan mengelolanya sesuai sistem pendidikan Nasional.