Kepemimpinan lembaga pondok pesantren pada umumnya mutlak dipimpin oleh seorang kyai.Eksistensi kyai sebgai pemimpin lembaga pesantren jika ditinjau dari tugas dan fungsinya,bisa dipandang sebagai suatu hal yang unik,hal tersebut dikarenakan seorang kyai memegang peranan yang subtansial pada lembaga pesantren