Pembelajaran muatan lokal kitab kuning di MTs Salafiyah Wonoyoso Kebumen masih menggunakan metode tradisional pondok pesantren. Dengan pembelajaran kitab kuning khususnya kitab fiqih, peserta didik lebih memahami materi pembelajaran fiih dengan lebih baik dari pada madrasah lain. Kendala yang dihadapi dalam pembelajaran kitab kuning adalah metode yang digunakan, namun kendala tersebut dapat diatasi dengan pembelajaran fiqih yang lebih maksimal.