Madrasah tidak lepas dari mata pelajaran yang meliputi al-Qur'an dan hadist, aqidah akhlak, fiqih, sejarah kebudayaan Islam, dan bahasa Arab. Oleh karenanya ciri khas madrasah adalah diajarkannya pendidikan agama Islam secara luas dan mendalam. Materi tidak hanya diketahui siswa tetapi harus diamalkan dalam kehidupan sehari-hari.