Fungsi pondok pesantren tidak kalah pentingnya adalah bahwa pondok pesantren berfungsi sebagai lembaga pembangunan dan pemberdayaan masyarakat. Jadi pesantren sebagai sebuah sistem pendidikan telah memberikan kontribusi yang nyata bagi perkembangan agama Islam di Indonesia. Sebagai institusi yang asli Indonesia pesantren mampu menduduki posisi yang relatif penting dalam masyarakat dan mampu bertahan sampai saat ini.